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バイオグリッド スパコン創薬プロジェクト

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KBDD (K supercomputer-Based Drug Discovery project by Biogrid pharma consortium)プロジェクトとは、NPO法人バイオグリッドセンター関西が運営しているスパコンにおける創薬基盤を構築するコンソーシアムで、製薬企業約20社、IT企業2社、京大、阪大、産総研、横浜市大、兵庫県大、千葉大・医、都市活力研究所、神戸医療産業都市推進機構が参画しています。
2012年度には、蛋白質約600と低分子化合物3000万の相互作用を機械学習法(SVM)で計算し参画の製薬企業にデータを提供しました。
また、2012年度から蛋白質と化合物の結合自由エネルギーを見積もるアプリケーションMP-CAFEEの産業利用の可能性について検証を行なっており、計算精度の検証、一連のワークフローの構築、GUIの開発などを行なってきました。今後はこれらのノウハウを提供し、創薬の現場で利用できるようにし、さらに新たなアプリケーションについても順次検証を行い、創薬現場で利用できるようにする予定です。現在はMSM法を利用したKon、Koffの算出に取り組んでいます。

KBDDメンバー

申請主体

NPO法人バイオグリッドセンター関西

製薬企業(50音順)

科研製薬(株)

(株)カネカ

キッセイ薬品工業(株)

住友化学(株)

千寿製薬(株)

大正製薬(株)

田辺三菱製薬(株)

中外製薬(株)

東レ(株)

日本新薬(株)

マルホ(株)

IT企業

三井情報(株)

大学(以下順不同)

京都大学大学院 医学研究科

大阪大学

兵庫県立大学

横浜市立大学

千葉大学 医学部

公的機関

(公財)都市活力研究所

産業技術総合研究所

(公財)神戸医療産業都市推進機構

理化学研究所



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